キャラクター選択画面にキャラクターが表示されていない場合、以下の原因が考えられます。

◆ゲームポットIDからの移行手続き後にキャラクターが表示されない場合、以下のFAQをご確認ください。

移行手続きをしたのに、データが移行されていません。
http://support.jp.square-enix.com/faqarticle.php?kid=74327&id=13021

◆キャラクターが所属するワールドがメンテナンス状態になっている
表示されていないキャラクターの所属するワールドにおいて、メンテナンスが実施されている、もしくは障害が発生している場合、一時的にキャラクターが選択画面上に表示されないことがあります。

これはキャラクターが消失してしまっているのではなく、メンテナンスや障害により一部のゲームサーバが一時的に停止していることが要因です。

公式サイトのお知らせを確認し、所属しているワールドにおいてメンテナンス作業や障害が発生していないかをご確認ください。

◆キャラクターを削除している
別のキャラクターないしアカウントと間違えてキャラクターを削除されている、または第三者により不正にアカウントを使用されて削除されているなどの場合、状況の詳細を記載のうえで、お問い合わせください。